昭和
44年2月- 創業者阿部公明が長崎市田中町（矢上）に１０坪の冷蔵庫（Ｃ級）建設
45年11月- 矢上冷蔵有限会社を設立資本金100万円
45年12月- 同上田中町にＮＯ，２・３冷蔵庫（Ｃ級）竣工
47年1月- 同上田中町にＮＯ，４冷蔵庫（Ｆ級）竣工
47年5月- 倉庫業営業許可取得
49年1月- 資本金500万円
49年3月- 島原市三会倉庫借庫
49年5月- 大村市富の原に関連会社「富の原産業有限会社」設立
49年8月- 同上富の原に大村ＮＯ，1冷蔵庫（Ｆ級）竣工
49年11月- 旧北高来郡飯盛町平古場に冷蔵庫（Ｆ級）竣工
53年3月- 倉庫証券発行許可取得
53年4月-（現本社である）諫早市飯盛町佐田にＮＯ，1冷蔵庫（Ｆ級）竣工
53年12月- 同上飯盛町佐田にＮＯ，２冷蔵庫（Ｆ級）竣工
53年12月- 大村市富の原にＮＯ，２冷蔵庫（Ｆ級）竣工
54年12月- 本社飯盛町佐田にＮＯ，3冷蔵庫（Ｆ級）竣工
56年6月- 同上飯盛町佐田にＮＯ，4冷蔵庫（Ｆ級）竣工
56年11月- 大村市富の原にＮＯ，３冷蔵庫（Ｆ級）竣工
56年11月- 長崎市田中町（東望）にＮＯ，1冷蔵庫（Ｆ級）竣工
61年7月- 自動車運送取扱業許可取得
平成
元年9月- 本社を長崎市田中町（矢上）から旧北高来郡飯盛町に移転
4年12月- 長崎市田中町（矢上）ＮＯ，1～３冷蔵庫、土地区画事業により廃止
6年4月～9年3月- 阿部公明、長崎県冷凍協会・冷蔵倉庫協会会長在任
14年3月- 島原市三会倉庫返還
14年4年～16年11月- 阿部公明、長崎県冷凍協会・冷蔵倉庫協会会長在任
16年11月- 創業者阿部公明７２歳で死去
16年11月- ２代目阿部浩明代表取締役に就任
18年4月～23年10月 阿部浩明 長崎県冷凍設備保安協会会長
18年4月- 一般貨物自動車運送事業許可取得
18年5月- 社名をナガサキロジスティクス株式会社に変更
19年4月～ 阿部浩明 長崎県冷凍協会・冷蔵倉庫協会会長
21年9月- 関連会社「富の原産業」と合併（事業譲渡）
21年9月- 代表取締役 石橋良隆（旧富の原産業）
24年2月- 代表取締役 阿部浩明就任
28年8月- 諫早物流センター開設
28年9月- 東望工場閉鎖
30年2月- 福岡運輸株式会社と業務提携、福岡運輸株式会社グループ会社へ
令和
3年3月- 長崎物流センター地鎮祭（工事着工）
4年5月- 長崎物流センター竣工
4年5月- 飯盛町佐田本社、大村富の原大村工場 閉鎖
4年9月- トラック太陽光実証実験開始
5年1月- 長崎物流センター屋根太陽光パネル180kw（自己消費）搭載完了
5年9月- 長崎県SDGｓ認証取得